瓦萨博物馆顶部呈深红色，是一座桅杆状装饰的建筑物，远远望去就像停泊在水中的一艘战舰。由于这座建筑是一座半地下建筑，所以并不显得十分高大。
    这个的博物馆就建在当年建造瓦萨号的海军码头旁，共分地下层和地上层（入口就是4层）。博物馆入口的四楼，除了设有餐厅、纪念品店、电影厅及讲课厅等服务设施之外，展示区介绍着这艘国王战舰建造的目的、海上权威的彰显，以及沉没时的情形。以幻灯片播映方式说明瓦萨号沉没的原因，并以模型来说明瓦萨号的沉没与沉没后的找寻与打捞过程。
    瓦萨战舰是当时最大的战舰，建于380多年前，以瓦萨王朝第一个国王的名字命名。由于构造上的问题，下水没多久就沉没了。此后，瓦萨战舰在海底停留了333年，到了1961年才打捞了出来。瓦萨博物馆的这个战舰有5层甲板，配备64门火炮，这艘复原的战舰是用13500块碎片拼凑合成的，船上有很多精致的木雕，尤以船尾的最为精彩。栩栩如生的雕刻有戴盔披甲的威武骑士，有婀娜多姿的美人鱼，有挥剑砍杀的罗马士兵，有希腊神话里的各色人物，有形形色色的纹章，还有象征着美好和纯洁的裸女。雕塑品的最上部则是护卫瑞典皇家盾形纹章的两只雄狮。还有当时瑞典国王自比齐肩的20位罗马皇帝的雕像。