公园总面积26401亩，核心区六千多亩，地形属戴云山脉南段博平岭东伸支脉中山地。山势陡峭，沟谷交错，起伏变化较大。其气候属南亚热带北缘与中亚热带过渡气候带，年平均温度17.40C，夏天最高气温也只有二十多度，为避暑胜地。 植被为天然常绿阔叶林，森林覆盖率达95%以上。1993年7月由福建林学院部分专家教授组成的调查组对贡鸭山进行综合的科学考察，调查结果表明：山上共有植物种类120科273属428种，其中国家重点保护植物有穗花衫、福建柏、福建青冈、红锥、大果马蹄荷、红豆树等；昆虫有11个目97科717种；蝶类资源丰富，漳州教育学院蝴蝶研究专家徐奇涵从1997年5月至2001年9月，连续四年到贡鸭山进行了10多次的实地蝴蝶考察，共采集标本二百余种。