额尔古纳市历史悠久，是举世公认的蒙古族发祥地，隋唐时期，蒙兀室韦部落就在这里游牧狩猎，繁衍生息。清康熙二十八年，即公元1689年，《中俄尼布楚议界条约》签订，确定额尔古纳河为中俄界河，至今未变。
    额尔古纳河是黑龙江的右上源，额尔古纳市也得名于额尔古纳河，“额尔古纳”为蒙古语，意为“捧呈、奉献”。当海拉尔河从大兴安岭发源，流至呼伦贝尔草原西部扎赉诺尔北阿巴该图附近时，突然转向东北流去，其形正成165°，有如人捧呈递献东西之状，故从此处改河名为额尔古纳河。