航空
东京共有4个机场，其中最大的是成田机场和羽田机场。从中国前往东京，一般都在成田国际机场降落，而羽田国际机场目前主要面向日本国内和韩国的一些航班。北京到东京国际飞行时间约3小时30分钟。
成田国际机场：位于东京附近的千叶，距东京60公里。从成田机场可以乘坐机场巴士、出租车、JR（有轨电车）等交通工具前往市区。其中机场巴士和出租车都在候机楼发车，出租车票价较贵，去东京大概需要1万5千日元。机场巴士车票为3000日元/人，15分钟一班，乘机场巴士直达东京站、东京迪士尼、银座、羽田、池袋、新宿等地区，但需时间较长。
在第一和第二候机楼地下设有JR站点，有成田特快（缩写为N'EX）和京成特快两种列车全天候服务，每30分钟一班。其中成田特快列车速度较快，有“横滨”、“大船”、“新宿”、“池袋”、“大宫”等五条线路途经东京站，票价为2910日元，而“京成特快”速度较慢，但是发车次数更多，每20分钟一班。
附： 成田机场特快的运营班次
运行区间
运行时间
单程票价
东京车站－成田机场
约1小时
2,940日元
品川车站－成田机场
约1小时10分
3,110日元
新宿车站－成田机场
约1小时20分
3,110日元
池袋车站－成田机场
约1小时30分
3,110日元
横滨车站－成田机场
约1小时30分
4,180日元
附：京成特快的运营班次
运行区间
运行时间
单程票价
京成上野车站－成田机场
特快 约1小时15分
1,000日元
快车 约1小时40分
1,000日元
羽田机场：即东京国际机场，和成田机场比较起来，离东京市区较近，对游客来说也比较方便。
利木津巴士(Limousine Bus) 从羽田机场到东京市中心约需60分钟车程，停靠站有赤板、池袋、品川、银座、新宿等。票价为1200日元。车站位于机场国内线区1楼。
东京(Mono Rail)线从羽田机场到终点滨松町约需22分钟车程，下车后可再转乘JR山手线抵达想去的目的地。票价为470日元。车站位于机场国内线区的B1。
京滨特快电车(Keihin Kyuko)从羽田机场到东京市中心约需14分钟车程，票价为400日元。本电车与JR山手线品川站相连结，转车也十分方便。
铁路
东京为日本六大铁路干线交汇点，分别是新干线、东海道本线、东北本线、中央本线、常磐线与总武线。东京有20多条铁路呈放射状通往全国各地，四通八达，可与本州、九州等地联通。
公路
长途巴士：在日本长途巴士一般都是傍晚出发早上到达，费用又比飞机和新干线便宜，座位是可调整任意角度的活动软座，因此十分舒适。从东京乘坐长途公共汽车可以直达青森、秋田、仙台、新泻、长野、名古屋、金泽、京都、大阪、奈良、神户、广岛、博多等城市和地区。